晶码战士2拓也他们到了数码世界的一个浮起的岛，这个岛上的人型数码精灵和兽型是完全对立的，人型的数码精灵帮助了拓也、友树和纯平，而兽型的数码精灵则协助辉二和泉，拓也和辉二竟就此打起上来，后来因其它数码精灵哭了起来而停此。人型的剑道兽，与兽型的小熊兽是好朋友，他们说起洞穴里有古代的数码精灵，认为如果仍然存在的，必定可解救这个岛。两种型态再次战争，拓也进化成炎龙兽......